Le Département de génie mécanique offre deux modalités de masters: Master of Science (MS) en génie mécanique et Master of Engineering (ME) en génie mécanique. Dans chaque modalité deux spécialisations sont proposées: l'aérospatiale et de l'énergie.

Le programme de maîtrise en génie de la fabrication permet aux diplômés d'acquérir une connaissance approfondie des technologies de fabrication actuelles et nouvelles, telles que les processus de fabrication continus, les problèmes réglementaires affectant la fabrication, la gestion des risques de qualité, le Lean Six Sigma, les outils de prise de décision, ainsi qu'une connaissance approfondie de aspects clés concernant l'exploitation et la gestion d'une industrie de haute technologie. Ces connaissances les prépareront à assumer des postes pertinents au sein de sociétés de fabrication, de recherche ou de services à Porto Rico, aux États-Unis ou à l'étranger.

Le programme offre une combinaison de technologie et de matières de gestion afin que les diplômés puissent contribuer au développement économique de leurs sociétés. Le programme dotera les étudiants des connaissances, des compétences et des attitudes nécessaires à l'emploi dans la gestion des environnements techniques et / ou à l'admission dans des écoles supérieures pour poursuivre des études supérieures en gestion de l'ingénierie ou dans des domaines connexes.

Le programme de maîtrise en génie électrique (ME) est conçu pour préparer les étudiants avec les connaissances, les compétences et les attitudes nécessaires à l'exécution des professionnels comme efficaces et hautement qualifiés dans les spécialisations de Power Systems et de contrôle. Les deux spécialisations sont axées sur la modélisation, la conception et la connaissance pratique des systèmes.

L'expérience et la pratique professionnelle sont des éléments essentiels dans la formation d'un ingénieur, mais une connaissance approfondie des fondements des différents domaines du génie civil (CE), et le développement de solides compétences analytiques basées sur des connaissances, des méthodologies de pointe, et les techniques sont également nécessaires. Le programme d'études supérieures CE vise à promouvoir les études et la recherche avancées à l'Université polytechnique de Porto Rico. De plus, il cherche à impliquer les étudiants diplômés dans ce processus et à leur inculquer un désir intense de savoir.

L'Universidad Ana G. Méndez, Campus Gurabo offre les diplômes de Master of Science (MS) en génie mécanique et Master of Engineering (ME) en génie mécanique. La spécialisation Énergie alternative offre à l'étudiant la possibilité de se développer à travers des cours et des recherches sur la gestion de diverses sources d'énergie alternatives telles que l'énergie solaire, éolienne, océanique et les biocarburants.